文山马塘工业园区管委会原为文山市工业发展管理委员会。按照《中共文山市委关于成立文山马塘工业园区管理委员会的批复》(文复〔2012〕64号)精神,市工管委机构于2012年8月撤销并组建文山马塘工业园区管理委员会。按照《文山市人民政府关于成立文山马塘工业园区管理委员会的通知》(文政发〔2012〕76号)精神,文山马塘工业园区管理委员会于2012年12月31日正式挂牌成立,为市人民政府的派出机构,机构规格为副处级,内设党政办公室、规划建设科、招商引资科、社会事业科和农村工作科等5个科室,编制30人。2015年,为促进工作开展,市委编办批准成立环保安全科,为管委会内设科室,人员编制从管委会编制中调剂。